제가 질문을 잘 이해했나 모르겠습니다. ^^; 

 FPC 상단 우측의 MIDI NOTE에 표시된 노트 값을 좌클릭하시면 다음과 같은 창이 뜹니다. 각 패드 마다 값을 지정해줄 수 있습니다. learn 버튼을 누르신 뒤에 할당할 패드를 눌러주시면 자동으로 인식이 됩니다. 아니면 드럼 패드를 미리 누르신 뒤 Last hit 버튼을 누르시면 드럼 패드에 FPC 패드를 할당시켜줄 수 있는 듯 합니다. 엄밀히 말하면 제 Nanopad의 첫 번째 패드는 미디 키보드의 C3, 두 번째 패드는 C#3에 대응합니다. 그래서 꼭 드럼 패드가 아니라 미디 키보드로도 Learn 버튼을 이용하시면 마찬가지로 각 건반마다 FPC 패드를 할당해 줄 수 있습니다. ^^;

 패드에 맞게 세팅하신 뒤에는 Save note layout을 누르셔서 현재 설정을 저장하실 수 있습니다. 한 칸 위의 Layouts에서는 'Use current Layout when changing presets'의 체크 유무를 설정할 수 있습니다. 보탬이 되었으면 좋겠습니다. ^^;

잠결에 적어서 그런지 정말 멍청하게 적었네요. -_-; MAP NOTES FOR ENTIRE BANK로 설정하시고 겹치는 패드들은 위에 말씀드린대로 Learn 기능으로 수정해주면 될 듯 합니다. 외장패드 하나를 눌렀을 때 FPC 둘 이상의 패드가 활성화되는 것은, 예를 들어 외장패드로 D#4를 입력한다고 했을 때 두 개 이상의 FPC 미디 값이 D#4로 겹쳐져 있기 때문입니다. 

겹치는 값만 Learn으로 수정해주시면 될 것 같습니다. 

아 이거 저도 연결 방법을 몰라 검색하다 알게 된건데 유튜브에 fl studio lpd8 검색하시면 배경화면은 lpd8이고 스튜디오로 등록하는방법 그리고 설정하는 방법

친절히 나와있더군요

혹시 몰라 좌표 찍어드립니다.

http://www.youtube.com/watch?v=3a1uRV_J9zw

아마 이렇게 안하셔서 그런듯합니다